银杏有抵御病菌侵袭的能力
有学者做过试验：把几种病原菌的芽孢涂在银杏树的叶片上，当芽孢在叶面萌发，吐出菌丝，18cm银杏树，形成菌丝体，压迫叶面蜡质层时，设法使菌丝体穿过角质层，北京银杏树，伸入细胞内部，促使叶片生病。结果发现，银杏的叶片并没有病态，庭院绿化，而被压迫叶子的细胞壁反而变厚。经研究发现，银杏的细胞组织内含有，乙烯醛和多种有机酸，如银杏黄素和白果黄素等多种双黄酮素，它们往往与糖结合以游离的方式存在，具有抑菌杀虫的威力，即使一些真菌侵袭到银杏的体内，也不能使银杏致病。
茎腐病是目前最受关注的一类银杏病害。感病初期，茎基部接近地表处表皮层组织及地下根部组织变褐色，产生水渍状病斑，25cm银杏树，地上叶片失绿、低垂，随之病部蔓延包围茎基，向苗木上部扩展，最终导致全株枯死，此时叶片桔黄下垂但不脱落。苗木茎皮层肥肿皱缩，剥开受害皮层，可见皮层下已腐烂呈海绵状或粉末状，灰白色，其问充满许多黑色细小的菌核。病害向根部扩展，使根系韧皮部褐色腐朽，皮层全部腐烂，其上生灰白色菌丝体，用力拔苗，可见根系皮层脱落。
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