茎腐病是目前最受关注的一类银杏病害。感病初期，茎基部接近地表处表皮层组织及地下根部组织变褐色，产生水渍状病斑，地上叶片失绿、低垂，随之病部蔓延包围茎基，向苗木上部扩展，银杏树价格，最终导致全株枯死，此时叶片桔黄下垂但不脱落。苗木茎皮层肥肿皱缩，剥开受害皮层，可见皮层下已腐烂呈海绵状或粉末状，北京银杏树，灰白色，其问充满许多黑色细小的菌核。病害向根部扩展，使根系韧皮部褐色腐朽，皮层全部腐烂，其上生灰白色菌丝体，用力拔苗，可见根系皮层脱落。
中国的银杏——据研究，银杏类起源于石炭纪（3.45亿年）、银杏目起源于二叠纪（2.5亿年）以前，银杏属则起源于1．9亿年前的侏罗纪早期。现存的银杏其历史可追溯到7000万年以前的古新世（第三纪早期）。到了白垩纪后期及新生代第三纪银杏逐渐由盛变衰，第四纪冰川之后，18公分银杏树，在中欧及北美等地的银杏全部灭绝，只在我国保存一种。银杏的价值不仅在于它能跨越“有史时期”而生存下来，更重要的是它能在这漫长的“地质时期”保持该物种的遗传稳定。
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